С первых лет существования школы (1919 г. ) занятия по музыкальной грамоте, слушанию музыки и истории музыки стали обязательными.
Преподавателями музыкально-теоретических дисциплин в школе стали известные композиторы, музыковеды, активно участвовавшие в музыкальной жизни Петрограда-Ленинграда. Среди них Арсений Павлович Гладковский (работал в школе с 1925 года) – выпускник Ленинградской консерватории, ученик М.О. Штейнберга. Он был автором первой советской оперы на современную тему – «За красный Петроград». Среди сочинений Гладковского много произведений, отражающих различные эпизоды становления молодого советского государства. Это опера-оратория «Фронт и тыл» (1930), поэма «Памяти 26 бакинских комиссаров» (1931) и другие. Гладковский писал и музыку для детей. Некоторые из его фортепианных пьес до сих пор входят в репертуар учащихся музыкальных школ.
В 1930-е годы, музыкально-теоретические дисциплины в школе преподавали композитор Михаил Алексеевич Юдин, в будущем профессор Ленинградской и Казанской консерваторий, музыковед Юрий Кондратьевич Белый, ученик Б.В. Асафьева, научный сотрудник Института истории искусств и параллельно преподаватель ленинградской консерватории, автор путеводителей по операм Н.А. Римского-Корсакова и М.П. Мусоргского. Некоторое время преподавала Елена Михайловна Орлова – выпускница Ленинградской консерватории, впоследствии выдающийся музыковед и педагог, профессор Ленинградской и Уральской консерваторий, автор фундаментальных трудов «Лекции по истории русской музыки» и «Очерки о русских композиторах XIX начала XX века».
Среди учеников, закончивших школу в довоенное время, есть известные музыковеды и композиторы, которые внесли большой вклад в формирование культурной среды Санкт-Петербурга. Это Всеволод Владимирович Коргузалов – музыковед-фольклорист, сотрудник Пушкинского дома, участник Великой Отечественной войны, автор научных трудов о русской народной песне, Роман Николаевич Котляревский – композитор, музыкальный редактор.
В числе выпускников послевоенных лет такие известные музыканты, как автор популярных песен и киномузыки композитор Станислав Пожлаков, пианист и органист Сергей Цацорин.
Руководитель отдела - Киселёва Наталья Владимировна, заместитель директора по учебной работе.
Преподаватели отдела сегодня – это творческие люди, по инициативе которых в школе проводятся многие творческие мероприятия. В их составе Лариса Вениаминовна Ефремова, Анастасия Владимировна Смирнова (Ващенко), Леся Васильевна Маловик, Елена Андреевна Бойко, Федор Кириллович Комов, Олеся Леонидовна Командышко.
В программу обучения входят такие предметы, как «Сольфеджио», «Слушание музыки», «Музыкальная литература», «Музыкальный Петербург». Благодаря профессионализму и педагогическому мастерству преподавателей, учащиеся школы ежегодно показывают высокий уровень знаний на городских олимпиадах, проводимых Ресурсно-методическим центром Санкт-Петербурга, а также различных конкурсах теоретической и композиторской направленности.
Кроме того, сами преподаватели являются участниками многих научно-практических конференций, авторами учебно-методических пособий. Выполняя требования к дополнительным предпрофессиональным программам в области искусств теоретический отдел ежегодно проводит открытые уроки для родителей, школьные олимпиады, конкурсы диктантов и многое другое.